Für den Datentransfer verwende ich eine virtuelle Windows-Maschine. War am stressfreisten. Wenn die Daten dann auf der Platte sind bist du ja relativ flexibel was die Nutzung von Software angeht. Ggf. lässt sich dann die Suuntu-Software mit wine installieren. Ich denke mal die Krux ist die Datenübertragung.
Mit wine habe ich mal versucht, meinen Ant-Stick (Garmin) an's Laufen zu bekommen, war aber nix, bin aber auch kein wine-Fachmann...