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Das ist ja die spannende Frage und sicherlich nicht ganz eindeutig zu beantworten. Die Reize für den Stoffwechsel, die Mitochondrien sind ja äquivalent wie du ja schon geschrieben hast. Was den Einfluss für die Muskeln angeht bin ich mir nicht sicher, da sich das sicherlich noch recht schnell kompensieren lässt. Schwieriger würde ich jetzt die ausbleibenden bzw. geringeren Aufprallkräfte für die Sehnen, Bänder, Knochen und Gelenke. Das spielt aber auch vermutlich nur eine Rolle für richtig schnelle oder richtig lange Belastungen.
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